老师您好，最近在做一些研究，想要利用Yeo模版提出的7个功能网络进行一些研究，但是目前只能将结果映射到AAL模版中，或者DK模版中，那么我如何确定哪几个脑区属于某个网络啊，查阅了相关资料，介绍可以利用脑区的MNI坐标进行实现，但是不知道MNI坐标如何获取
如果你有AAL或者DK模板的文件，可以使用FSL的fslstats命令来获得每个脑区的中心坐标：
fslstats -K AAL.nii.gz AAL.nii.gz -c
这个问题在前面的帖子中也讨论过。
除了根据坐标，也可以通过计算不同分区模板的脑区的重叠程度来建立映射关系，这个问题在前面的帖子中也讨论过。
老师您好，因为不是专门进行影像学研究的，因此对于处理结构像的操作工具并不是很了解，有没有其他更加简单的方式获取呢？比如说利用brainnetview获取？
哈喽，森森
想要查模板中的ROI属于哪个网络，可以使用afni处理
首先这些模板得属于同一个空间(e.g. 都在MNI_2009c_asym)，可以使用3dinfo -space dset查看空间信息
然后使用3dCM -all_rois -Icent dset > dset_Coordinates.1D，这会计算模板中所有ROIs的质心坐标，-Icent参数可以使质心坐标不会超出ROI
通过质心的坐标判断ROI属于哪部分网络，通过whereami查询，你可以指定x，y，z的坐标，可以通过-coord_file传入一个.1D文件。
具体的模板可以在afni的abin下搜索AFNI_atlas_spaces.niml查看信息，Yeo7与Yeo17的模板在这个连接当中https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/atlases/SchaeferYeo/afni_sydist_atlas_v1.0.tgz
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- 我去看了一下在Brainnet Viewer（v1.7）里自带了AAL和DK的坐标文件，你可以直接使用。
- 如果是使用图形界面软件的话，PANDA提供了一个将两个分区模板进行映射的功能（
Between-atlas Mapping）。你同时输入两个分区模板（比如，一个AAL，一个Yeo7），会得到AAL每个脑区与在7个网络中的占比。虽然不是提供MNI坐标，但是能解决最终的问题。PANDA下载地址：https://www.nitrc.org/projects/panda。 - 能提取MNI坐标的图形化软件我一时还想不到。
谢谢老师，我现在去研究一下
好的谢谢，我去研究研究，谢谢你的回复
你好，请问你实现了将aal模板的ROI映射到了yeo7模板上吗？也许我们可以交流学习，qq:2373667422
请问您实现这个步骤了吗？可以向您请教吗？QQ：2383170896
我尝试了用该工具做映射，但结果所指示的信息不太清楚。用的是Schaefer2018_800Parcels_7Networks_order_FSLMNI152_2mm.nii.gz与AAL90.主要想知道，Yeo中的几个网络映射到AAL90的那些节点
PANDA设计人员真是一个沉默寡言的人
如果你感兴趣的是Yeo7/Yeo17网络和AAL的对应关系，最简单的应该是直接用Yeo7/17网络模板（https://github.com/ThomasYeoLab/CBIG/tree/master/stable_projects/brain_parcellation/Yeo2011_fcMRI_clustering或者https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/CorticalParcellation_Yeo2011）去和AAL进行映射。Schaefer2018是另外一个分区模板，然后每个脑区和Yeo7/17做了映射，你的做法相当于是Yeo7/17 → Schaefer2018 → AAL，如果没有其他考虑，不如Yeo7/17 → AAL合理。
请问wu，这7个网络中的Parcels怎么和AAL90.nii模板对应起来呀？比如stable_projects/brain_parcellation/Schaefer2018_LocalGlobal/Parcellations/MNI/Centroid_coordinates/Schaefer2018_100Parcels_7Networks_order_FSLMNI152_2mm.Centroid_RAS.csv与AAL90之间的对应关系。
感谢指正
您好，请问您这边有AAL 116模板到yeo7模板的对应关系吗？非常需要您的帮助！
qq:1420462013
我写了一个简单的GUI工具，你可以试试看能否解决你的问题。
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