freesurfer如何用AAL模版来提取皮层厚度，脑沟回等

这种情况很正常，因为在边界的地方是有一些不确定性，因为你是从annot转到MNI的，所以和原始的AAL不是完全对应的。一个量化的方法就是算一下重合比例，比如LH_region_16和Insula_L重合率为10%，与Rolandic_Oper_L重合率为80%，那么LH_region_16应该就是对应Rolandic_Oper_L。这个问题在匹配不同分区模板的时候也会出现，在前面的帖子1、帖子2中讨论过。