DTI相关的MD/FA图是怎样画出来的


我们有对应的FA与MD值,怎样画出这样的图呢?
是用的很常见的27个纤维束的那种模板。

  1. 从图中看出应该展示的是每个tract的T值,所以首先需要根据tract的模板文件(3D图像文件),将每个tract的T值赋值给每个tract包含的体素,从而得到一个T值的3D图像。用这个图像去进行可视化。
  2. 如何进行3D可视化,我目前也没有找到比较满意的方案。但是可以用BrainNet Viewer去做(参考使用手册),或者ITK-SNAP/ParaView的方案(参考这篇文献: Madan C. R. (2015). Creating 3D visualizations of MRI data: A brief guide. F1000Research, 4, 466. https://doi.org/10.12688/f1000research.6838.1)。
  3. 可以考虑去NeuroStars论坛问问,可能会有更好的解决方案。