我正在进行一项ALE元分析，想使用FreeSurfer软件把Yeo的七个网络Add到MNI152模版之后，把ALE元分析数据再Add到7网络模版上，分析元分析结果的体素是否重叠于多个网络，进而分析出体素的个数，表述可能不是很清晰，因为是小白，所以请求关注到的老师或者朋友给与指导或者帮助，非常感谢！
不是很明白你的问题，听起来似乎是，你想将ALE图谱和Yeo7网络图谱计算一个重合程度（overlap），看看激活主要集中在哪些网络？
是的，我有一个病变图，想将其叠加在 yeo 模板上，以量化与不同网络重叠的病变体素的数量；，我正常尝试使用FreeSurfer打开nii格式文件，但是我还没有找到有效处理方法，并且我还正在尝试MRIcroGL兼容的 Yeo2011_7Networks (CorticalParcellation_Yeo2011 - Free Surfer Wiki)) 模板？
你可以把ALE图谱里的每个团块（cluster）保存成一个mask，然后对于每个mask，计算这个mask与Yeo7图谱中每个网络的重叠体素数。如果你只是想把ALE图谱当作一个整体，那么可以直接计算与Yeo7图谱中每个网络的重叠体素数。具体使用何种工具来实现，取决于你熟悉什么工具，比如可以用FSL或者Matlab来实现。
感谢你的解答，但是我是个小白，你所讲述的方法现在根本没明白，我再仔细研究一下