关于多中心数据的分析

麻烦各位老师能够帮忙解答一下问题,感谢!我的问题是
1.多中心不同机器,不同参数采集的静息态数据,比如有TR时间2s的,multiband0.8s的,0.75s的,这些数据用DPARSF预处理并计算了ALFF,后用SPM进行两组间比较,想回归掉多中心这个因素,协变量如何添加?能否设置为1,2,3····这样子?
2.多中心数据如果想用GIFT做ICA分析,该如何进行?能把多中心所有病人和健康对照一起做ICA分析吗?还是每个中心分开分析,然后找共同的网络统计分析?

  1. 如果想把TR作为协变量,可以直接把TR放入模型(即把实际的TR值作为一列放入设计矩阵中)。但是不同中心采集的数据往往不止TR不同(即使扫描参数完全相同,还有机器本身带来的站点效应),如果是用1/2/3表示不同站点,那么1/2/3表示不同类别,不能当作一个连续变量放入模型,要用分类变量的方式放入模型。根据我的文献了解,我个人更建议先用ComBat去除ALFF或者其他指标中的站点效应,再用去除站点效应以后的数据去做常规的统计分析。
  2. 我个人倾向于先用所有数据一起做ICA,在对每个被试的网络使用ComBat去除站点效应,最后用去除站点效应后的数据做常规统计分析。每个站点分开分析的问题是,寻找共同网络并非很容易的事情,容易被质疑。
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感谢 Alex老师的回答!