freesufer处理分组glm分析时报错

[lymasd]

如以上的图，使用freesurfer跑GLM但总是报错，不知道为什么报错该怎么修改，请老师们帮忙指点一下问题，并且想请教一下

这样的两组，加上gender和age的协变量，该怎么写mtx文件呢？谢谢老师们

[Alex]

1. 在报错信息里有说明报错原因，需要在mri_glmfit命令里加上--eres-save选项。也可以参考我的博客。
2. 不关心的协变量对应的位置写0即可，在你的例子里就是1 -1 0 0。可以参考官方文档里给出的一些例子：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsgdExamples。另外，你这里将性别作为一个连续变量进行处理，官方文档的例子里是作为分类变量进行处理的，结果应该是一样的（你可以实际测试一下）。

[lymasd]

好的感谢老师，已经解决了！

目前与老师的文档不同的是--2space已经废弃，可以使用这样的脚本

[Alex]

我刚看了一下，在FreeSurfer 7.4.1，--2spaces选项仍然是有的，这个选项要校正的是左右半球的多重比较。