求助各位老师们,我在使用gretna进行图论分析,gretna自带解剖学以及功能分区模板,我不想基于全脑,而是想基于感兴趣区做图论分析,伏隔核以及中脑腹侧被盖区是我关注的两个核心脑区,但是发现所有的模板上都没有细分这两个脑区,我应该如何确定这两个脑区呢?
- 伏隔核(accumbens)很多分区模板都有。腹侧被盖区(VTA)确实不清楚有没有现成的分区模板。
- 一般定位脑区要么是有分区模板(通常解剖专家手绘),要么就只能自己手绘。
非常感谢回复,我查了几个解剖区和功能区的模板,没有找到伏隔核的,比如在AAL模板上,只有尾状核和壳核,没有看到细分的伏隔核,请问哪些模板上能找到伏隔核呀。
自己绘制分区模板是不是难度很大,一般自己做的ROI模板是不是都不带分区呀
- 除了 @XH1 提到的FreeSurfer的Aseg分区,FSL自带的Harvard-Oxford分区,SPM自带的Neuromorphometrics分区等,都是有accumbens的。
- 自己手动勾画脑区需要有相当的解剖学知识和对应模态的数据。有些核团或者脑区在T1图像上是看不见的。
- 如果要研究VTA分区,最好的方式我感觉还是去找文献。如果有文献做,那么可以照着文献的方法去试试。比如别人可能已经勾画了VTA,你可以直接拿过来用(如果对方愿意分享的话)。
好的,非常感谢!
好的,明白了!非常感谢解答疑问,确实找到了伏隔核分区的模板,关于VTA我再去读读文献,非常感谢!!