求助如何使用gretna比较3组以上被试的图论指标差异，并进行事后比较

问答讨论
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求教一下各位老师，我用gretna构建了7组被试的脑功能矩阵，并计算出了全局和局部图论指标，下一步想比较这7组被试在这些指标上的差异，并进行事后比较，但在使用gretna分析时，发现选择方差分析，只能输出7组之间是否存在显著差异，我应该如何得出事后比较的结果呢？还有想要进一步使用NBS方法看具体是哪些功能连接存在差异，但是发现gretna好像只能比较两组的？

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  1. 我没用过gretna做统计，不清楚是否有相应的功能。如果是为了得到事后检验的结果，也许可以再跑一下两两之间的T检验，结合方差分析和T检验的结果来分析。
  2. 可以考虑直接用NBS工具包来做，NBS工具包各种模型都可以。
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非常感谢您的及时回复！去看了NBS工具包的使用手册，确实可以分析多组被试的功能连接矩阵差异。
但是关于第一个问题，我是基于AAL模板进行的图论分析，这样每个被试都有90个脑区的图论指标结果，在分析多组被试具体在哪些脑区的图论指标差异时碰到了难题，还是不知道如何解决。我想的解决方案是gretna可以输出多组被试在哪些脑区的图论指标上存在差异，我能基于这些存在显著差异的脑区，提取出每一组的图论指标值，再进行一次方差分析嘛？
还看到有的文献里面在比较不同组的图论指标差异时，使用的是非参数置换检验，不知道这种又是如何实现的呢？

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  1. 我觉得没问题，不管什么统计软件，同样的分析结果应该是完全一样。我前面说的意思是，用gretna的方差分析找出哪些脑区是有差异的，然后再用gretna的T检验去看对应的脑区的两组结果。这样合起来作为一个完整的分析。
  2. 如果没有提到具体工具包的话，应该就是自己写代码实现的。如果要做置换检验，可以了解一下PALM工具包。
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好的，非常感谢您的回复，解答了我的疑问，决定尝试代码解决了。

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我个人日常也是用代码进行统计分析，因为这些（非专业的统计）软件自带的统计模块往往不够灵活，也做不了复杂的模型。

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嗯嗯好滴 还是得借助代码

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你好，请问这是 哪篇文献可以提供下名字吗？

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可以的，文献名字是Disrupted Brain Connectivity Networks in Drug-Naive,
First-Episode Major Depressive Disorder

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谢谢你 :grinning: