想问一下这个是用什么可视化工具画的?AAL可以用吗?


  1. 我不知道这些图是用什么软件画的,如果论文里没有写清楚,可以考虑写邮件去问一作,有一定可能能得到回复。
  2. FreeSurfer的freeview可以画这样的图,但是colorbar的选择可能没有这么丰富。我自己另外用过的是R环境下的fsbrain包,但是把部分脑区用黑线highlight出来的效果,我不确定能否实现。
  3. 你提到AAL,我不清楚你的具体问题是什么,不过要把AAL投射到皮层是有一定困难的,参考我们前面的讨论
  4. 我也去NeuroStars论坛搜索了一下,也有类似的讨论,你可以参考或者深入搜索一下。

好吧,谢谢老师

如果你是初学者,小白的话, 中文环境下有个brainnet viewr,可以平替下,虽然也不好。。。或者你搜下 Caret brain 试试

和Alex有相同的感觉,这个脑因为中间颜色灰白的可能来自于freesurfer,所以我感觉更可能来自于pysurfer,但是现代电脑上安装pysurfer比较麻烦。

和Alex一样,AAL因为是Volume上的划分,所以显示在皮层会有一定困难,你可以在github上找找有没有在皮层上做过对应。

谢谢,是pysurfer,我试过了,win系统没成功用起来,Alex老师提供的fsbrain也很好用,但目前AAL我还是用的ggseg来做可视化。