我们GE的数据拿到原始数据,都是显示MRDC标志,譬如 i10405692.MRDC.3 ;;;这个这个原始数据不可以用mricron和mango打开,MRDC格式的fmri数据是什么类型的哦?
还就是有没有办法转换为dcm格式的数据?
你有尝试过使用dcm2niix转换成nifti吗?
搜了一下,在dpabi的论坛上有个问题的题主有说明,可以参考一下。
已成功。。谢谢师兄。 同时提醒像我一样的文科生 dcm2niix -f %f_%p_%t_%s -o $output_dir -z n $input_dir
这里的$只是占位符,实际应用中不要保留
谢谢邓老师,这个是我发的 。。不过基本上已解决。。我在我们论坛的另一个我的帖子已说明
我去dcm2niix的github仓库搜索了一下MRDC
,发现没有相关讨论,因此我猜测dcm2niix是可以正常用的。因为dcm2niix使用特别广泛,更新也特别快,如果GE机器存在这个问题,应该有相关讨论。DICOM格式并非一定要以.dcm
结尾,因此单从文件名其实无法判断是否为DICOM格式。至于mricron/mango无法打开的问题,也许可以试试其他软件。比如,mricron已经是停更多年的软件,除非电脑系统很老旧,否则不建议使用。
师兄 有没有建议在linux上使用的看图软件,像mricrogl 和mango的?
dcm2niix 可以正常使用
如果说是直接看DICOM文件的看图软件,我没有用过。我一般常用的就是FSL自带的fsleyes和FreeSurfer自带的freeview。
我下载了 mrirroGL的linux版本 ,发现只能在MRIcroGL包目录里双击或使用 ./MRIcroGL打开图形化软件界面,如果换到其他的目录下。就是不行了。。 我正在看GitHub - rordenlab/MRIcroGL: v1.2 GLSL volume rendering. Able to view NIfTI, DICOM, MGH, MHD, NRRD, AFNI format images. 这里的 ```
lazbuild --build-ide= --add-package lazopenglcontext ./Python27-for-Lazarus/python4lazarus/python4lazarus_package.lpk
cd MRIcroGL
lazbuild -B MRIcroGL.lpr
谢谢师兄
之所以只能在当前目录打开,是因为在其他位置,系统并不知道有这么一个软件存在。比较简单的方法是,在.bashrc
文件中加入:
alias mricrogl=/home/Alex/MRIcroGL/MRIcroGL
这行代码的意思是用mricrogl
表示软件的绝对路径,这样你在任何路径下输入mricrogl
就可以打开某个文件夹下的软件。
如果你不熟悉Linux系统,比如不清楚什么是.bashrc
文件或者不知道怎么往.bashrc
文件里添加内容,可以多问问AI,我感觉这类问题AI是很擅长的。
谢谢师兄。 今天我尝试下
我前面的回复里漏掉了最关键的alias
命令,已经修改了。