关于MRS和fMRI的一个问题

我在MRS中用的体素框是3×3×3的,稍微带一些倾斜的,基本上包括了两侧的ACC。而后我在进行fMRI分析的时候,由于自己无法划出倾斜的ROI,所以选择的种子点是来自AAL模板的L-ACC和R-ACC。
想问下这种情况如果后面我在进行MRS和fMRI的相关分析,是否可以?
如何解释这种体素框和种子点不完全一致的情况。或者是否有更好的方法呢?

我没有做过这类数据,我感觉就算MRS的ROI没有倾斜,你用AAL的模板也会有较大的偏差,因为边界也是不清楚的,比如AAL的ACC边界肯定是不规则的。类似的情况我能想到的是在TMS干预中,这个干预涉及的脑区范围也是不清楚的。

谢谢老师回复。我看过类似的文章。经常轻描淡写的就是获得mrs体素框作为mask(一个类似mrs的正方形框框)。也有一个研究海马的是用了MRS框框+aal的海马。但是自己试了几次都达不到倾斜的roi。
我想问下老师。那这样继续做可以吗。然后在limitation里面写上。(主要还是想问因为MRS框住了整个ACC,而fMRI则考虑左右脑功能差异分开了左右)。

我个人的想法是,如果你能知道MRS中的这个方形ROI的位置,可以考虑直接用这个ROI来做fMRI分析中的mask。你可以继续把这个方形ROI分为左右就行了。这样MRS和fMRI数据的结果一致性上应该是最好的。这样做会有什么困难吗?因为我没接触过MRS的数据。

因为好像文献里面ACC的MRS就是不分左右的,很多都是直接拉一个框框:


所以我们也没有额外自己做个分左右的~我看过海马有这样分左右的。
但是在静息态中我做不出来这样的mask。MRS操作的时候就是技术老师根据每个人T1位置做一个手动的框框,但是根据每个人的结构应该有细微的差别。

难点就是画不出这样的mask :sweat_smile:
试了marsbar大概能画出一个正方形,确实不能像老师您说的那样对齐。问了下核磁老师,他说MRS能划笔直的线,但是fMRI画这样比较难,是一个体素一个体素的。做不到倾斜。所以最后fMRI的时候选的是AAL的(也是没有更好的办法了)。
:老师您觉得除去不完全重合的这个情况,在退而求其次的情况下,bilateral ACC的代谢和左侧ACC(或者右侧ACC)的功能连接做相关会不会有问题呢 :rofl:
因为我知道脑内的代谢物对于BOLD有影响,也就是能够影响功能链接信号的~

我明白了,那就跟我前面提到的TMS差不多。虽然你这里有一个固定的体积大小,但是是特异于每个人的(依靠操作人员视觉定位?)。我刚才还在想,如果MRS操作过程中覆盖的位置的坐标能保存下来,应该可以直接对应到fMRI上。如果不能,那么选择AAL的ACC应该是合理的选择。

对,刚刚我自己尝试画了一个,老师您看看,就是只能是正方形或者长方形,不能倾斜:

对,老师那我打搅您,就是一般来说,文献中就是获得了这个体素框的mask,然后做整体的FC,我分开了,这样可以嘛 :grin:,谢谢老师~~

  1. 手动画mask是可以画成任何形状的,因为分区模板就是手动勾画的,比如AAL。
  2. 我觉得没问题,也要取决于你的研究问题和下的结论。

好嘞,谢谢老师~那我在研究研究~