ANTs配准问题

[zhongyk]

使用ANTS 进行配准:
/home/ants-2.5.0/antsRegistration.sh
-d 3
-f MNI152_T1_2mm_brain.nii.gz
-m F00011.nii.gz
-o movingToFixed_
-t s
#Deforming the moving image to fixed space:
antsApplyTransforms
-d 3
-i F00011.nii.gz
-r MNI152_T1_2mm_brain.nii.gz
-t movingToFixed_Warped.nii.gz
-t movingToFixed_0GenericAffine.mat
-o T1movingToFixedDeformed.nii.gz
但是很快配准就结束了,

且配准后的T1图像不正确,是这样的:

[Alex]

你现在展示的这个图是哪个文件？

[zhongyk]

@zhongyk

T1movingToFixedDeformed.nii.gz

运用了变换后的T1(T1movingToFixedDeformed.nii.gz)

[zhongyk]

而且整个配准过程的时间也很短，只有十几分钟

[Alex]

你看看movingToFixed_Warped.nii.gz这个文件呢？

[zhongyk]

[Alex]

你看错了，我说的是Warped文件，这个是转换以后的图像。而Warp文件是变形场。我之所以看这个文件，因为这是antsRegistration.sh运行完就会产生的。

[zhongyk]

老师,这个就是生成的形变场,很奇怪

[Alex]

没懂你的意思，你可以把生成的文件都列出来？