各位老师同学们好,我想用Enigma工具包中的bigbrain moment 和我的数据来做相关
https://enigma-toolbox.readthedocs.io/en/latest/pages/11.01.bigbrain/index.html
我找到了其中的文件【enigma\shared\histology\bb_moments_schaefer_400.csv】,包含一个5(属性)*400(脑区)的数据,但是我不太清楚这五行分别对应了bigbrain-moment的哪些属性,在官网上也没有找到参考,想请教一下各位用过bigbrainwarp或者enigma的老师同学,他们的对应关系是什么?
有根据代码看出来其中的2,4代表的是 'Skewness’和 ‘Mean’
我没用过,不过我看到你好像在enigma的github issue里都问过了,也没有得到答复,而且从commit信息里也看不出来。
有一个小问题是,为什么以前版本的2行和新版本的5行完全没有什么关系。
是有关系的,以前的两行就是mean和skewness, 但是后来更新的版本加了三个东西
但是我看旧版本的2行和新版本的5行没有相同的数据:[ENH 🚛] Updated bb moments (python) · MICA-MNI/ENIGMA@e335199 · GitHub
Enigma官方的回复应该是最靠谱的,可惜没有回复(这个issue应该是你提的吧,我猜的 )。也许可以找找开发者的邮箱,直接写邮件去问问。
是我提的,我现在在试着用bigbrainwarp重新计算这五个属性(mean amplitude (intensity) of profile, as well as the mean, sd, skewness and kurtosis )
https://bigbrainwarp.readthedocs.io/en/latest/pages/tutorial_communities.html
以下代码应该可以解决这个问题
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