我的电脑是Windows系统，所以使用的是VMWARE的ubuntu虚拟机，用Freesurfer进行reconall对单个被试进行重建时还有很多内存没被利用，请问虚拟机上能否并行recon-all呢？
你给虚拟机分配了多少个cpu核心？如果是分配了多个核心，recon-all好像有个-openmp的选项，可以指定用多少个核心进行并行计算。此外，还可以直接打开多个终端窗口，同时运行多个被试的recon-all（这是一种粗糙的方式，如果你的电脑核心很多、内存很大，有必要借助专门的软件来管理并行任务）。前者是针对单个被试的并行，后者是针对多个被试的并行。
明白了,胡老师,我一开始是以为这种并行是依赖CUDA的配置之类的,现在看来不是,我用并行命令已经运行啦,感谢!
recon-all主要靠CPU，显卡再好也没用 