最近想把2种图谱合成,即YEO_7Network和OxfordThalamus图谱,看了一下好多都是从一整个图谱扣出感兴趣区,我想做丘脑亚区与7个功能网络间的连接分析,所以想把上述图谱合成,请问有小伙伴知道怎么操作吗?或者能实现上面的连接分析也行,感恩,谢谢啦
直接把两个图谱相加就行了,可能遇到的问题有:
- 这两个图谱所在空间不同,不过对于Yeo7和FSL自带的Oxford Thalamus应该问题不大。
- 两个图谱脑区有重叠,不过丘脑和皮层区域隔得很远,所以应该不用担心。
- 两个图谱标签有重叠,比如两个图谱都是从1开始编码,这个时候需要对其中一个图谱重新编码,使得两个图谱的标签不重叠。比如,假设Yeo7.nii.gz表示Yeo7图谱,标签从1开始编码,可以使用如下代码从21开始编码,再和丘脑图谱相加:
fslmaths yeo7.nii.gz -add 20 -mas yeo7.nii.gz yeo7_reindex.nii.gz
fslmaths yeo7_reindex.nii.gz -add thalamus.nii.gz combined_atlas.nii.gz
谢谢Alex老师!一打开邮件开心的不行,完美解决问题,也想到了我下一步可能出现的情况,感激不尽