我刚试了一下,好像没有找到类似的选项。SPM12里好像只能得到一个坐标位置的值。
请问老师CAT12如何把标准空间中统计分析产生的Mask配准到个体空间(体素级别)
(1)你在Segment的时候,在Deformation fields选项处要选择inverse deformation(或者forward+inverse);
(2)在CAT主界面上的Volume Tools处选项Apply Deformations,比如你是多个被试,每个被试只有一个文件,就选many subjects。具体的用法也可以看帮助信息。
好嘞老师,谢谢
老师 用ants或者fsl可以吗,我试了下cat12的 不太懂bounding box怎么设置,虽然反向配过去看上去没问题,但是后续好事像是因为维度问题会出错,而且虽然写的for many subjects 但是好像一次只能一个
老师 用ants或fsl把标准控件的图谱配准到个体空间具体命令是什么呢,不会让图谱label编号发生改变?用刚体吗?
(1)除了CAT12自带的工具,我记得SPM12的Deformations工具应该也可以。
(2)只要在插值方法上选择Nearest neighbour,标签的label就不会变化的。用ANTs配准效果好,FSL不太行。具体代码的话,可以参考这个回答:https://brainbbs.cn/t/ants/301/1
Alex,我有个小问题。我也用的是楼主的方法,提取了reho,falff的动静态指标,打算用他们与临床量表做相关。但是量表维度和阳性roi相对较多,我现在将所有指标做相关后进行多重比较校正发现十分严苛(FDR-BH),请教有没有其他的校正思路或者方法?
我暂时能想到的一些做法:
- 不校正,做一个
表量维度*脑区
的矩阵图,看看整体趋势,如果有一些非常明显的趋势或者模式,那么可以说明一些问题。 - 不校正,呈现未校正情况下显著的结果,但是在下结论的时候就要谨慎一点,比如考虑到没有校正的局限性。
- 筛选一些量表维度,比如只考虑存在组间差异的量表维度,或者只考虑总分,或者只考虑关键维度。
- 考虑到脑指标和量表的变量都很多,可以考虑多变量的方法,比如partial least square correlation,也是文献里常用的方法。也可以试试机器学习,比如用脑指标去预测每个量表维度的变化。
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好的好的,太感谢Alex这么及时的解答和建议了。我打算先用1,2再学习4