大家好，想请教大家一个问题，就是我们现在有一些肿瘤病人的磁共振数据（T1w,T2w,DTI和fMRI）,想对患者的脑组织进行肿瘤分割。因为之前很多研究都有发现，被肿瘤侵染或者包裹的脑组织内还有一些保留着原来功能的部分，所以我们想保留这些灰质和和白质的成分，在分割之前就没有加肿瘤的mask。但是我们用CAT12进行分割之后，发现很多肿瘤侵染的白质成分会被划分到灰质里面。所以想问问大家有没有什么比较好的分割策略。或者我们用DTI fiber track结果或者给FA的图像设置一个阈值，能不能将白质的成分提取出来呢。
你的问题是不是希望在存在肿瘤的情况下，仍然能正常分割出灰白质。我猜测CAT12把白质部分划分到了灰质，是因为被肿瘤包裹的白质在信号值上已经接近灰质了（比如正常白质是300，正常灰质是100，有病变的白质为150）？
是的，我遇到的是这样的情况，我又尝试了用SPM来做分割，感觉效果比CAT12好一点，但是不知道有没有什么更好的方法。
我猜测可能是SPM12的TPM在起作用，因为虽然（受肿瘤影响的）白质信号变化了，但是位置还是在白质。像CAT12（比较新的版本）这种对先验概率依赖比较少的算法，比较困难。也许你可以试试调一调SPM12的segment的参数，加大TPM的权重，可能有点作用。
不过另一方面，我觉得针对当前的问题，也许可以看成4类组织，灰质、白质、脑脊液和受肿瘤影响的白质，有些算法可以调分割的类别数目，也可能有点作用。
谢谢，那我试一下