atropos 进行组织分割未成功

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大家好，我用atropos 这个命令进行2类组织分割的批量处理时，发现有个别几个被试没有分割的结果，并且也没有报错信息提示。用antsAtroposN4.sh也试过 想问一下这可能是什么原因以及如何解决，谢谢啦~

具体命令如下：
1）Atropos -d 3 -a sub01.nii.gz -x mask.nii.gz -i Kmeans[2] -m [0.1,1x1x1] -o [segmentation.nii.gz,sub01_%02d.nii.gz] <无报错信息提示>

2）antsAtroposN4.sh -d 3 -a sub01.nii.gz -x mask.nii.gz -c 4 -p segmentationPriors%d.nii.gz -o output
<报错信息提示为：
Exception caught:
itk::ExceptionObject (0x2671d60)
Location: “unknown”

Description: itk::ERROR: AtroposSegmentationImageFilter(0x29ca750): Inputs do not occupy the same physical space! >

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你的sub01.nii.gz，mask.nii.gz和segmentationPriors是在同一个空间吗？

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我去搜了一下，应该是使用ANTs中常遇到的一个问题，造成这个错误的原因有多种，可以参考：https://github.com/ANTsX/ANTs/wiki/Inputs-do-not-occupy-the-same-physical-space

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谢谢回复，我看了一下 sub01和mask是在一个空间，但是segmentationPriors是不是组织分割后的结果

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好滴！非常感谢，我看一下。
就是感觉有点奇怪，批处理，为什么大部分被试可以，但是个别有问题

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segmentationPriors是先验信息，比如从公开数据中得到的。

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我刚才没有仔细看，你用的Atropos命令里并没有设置先验信息（和antsAtroposN4.sh不一样），所以可能是其他原因。我觉得可以单独跑一个未成功的被试数据，看看有没有报错信息。

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跑过，不过没有报错信息，直接命令行输入，然后进入下一个命令行，没有出现什么提示，只是发现没有生成的结果，而有的被试会有分割后的结果

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尝试了一下，应该是数据类型的问题，用fslmaths运算了一下可以了