想请教大家弥散像数据转为4Dnifty格式后为了和模板的方向一致在进行调整方向时遇到的问题:
之前发现可以使用mricrogl进行方向调整,在顺利完成了结构像的reorient后对于弥散像进行相同的操作,但是遇到调整方向后数据第四维度变少的问题,且对应的bval和bvec值都减少(见图一和图二),像请教大家有没有遇到过类似的问题,是什么原因,以及有没有解决的建议比如还可以使用什么办法调整方向(最好是可视化的,感觉自己现在对方向的感知还处于不太清晰的阶段),谢谢大家
想请教大家弥散像数据转为4Dnifty格式后为了和模板的方向一致在进行调整方向时遇到的问题:
之前发现可以使用mricrogl进行方向调整,在顺利完成了结构像的reorient后对于弥散像进行相同的操作,但是遇到调整方向后数据第四维度变少的问题,且对应的bval和bvec值都减少(见图一和图二),像请教大家有没有遇到过类似的问题,是什么原因,以及有没有解决的建议比如还可以使用什么办法调整方向(最好是可视化的,感觉自己现在对方向的感知还处于不太清晰的阶段),谢谢大家
我的初步理解是可能原本dicom文件转为nifty后图像与梯度信息已经分离,因为生成了bval和bvec文件,然后单独调整弥散像会使图像与梯度信息失去配对?但是如何将图像和梯度信息两者一起调整呢?
去Github(https://github.com/rordenlab/MRIcroGL)上问开发者Chris Rorden,回复非常详细而且及时,应该可以解决你的问题。
好的,谢谢Alex