大家好，我在做SBM的anova的报错如图1，basic model 和estimate 都没有问题，到roi analysi 就报错了（图1），做两样本t检验就没问题，spm和cat的工具包也重新添加路径了，依旧是如上报错；另外在提取surface的指标的过程中，发现部分病人运行过程中是红色的，请问这个是错误吗？但是最后也显示done，担心是由于原始数据的问题，请大家帮我看下，谢谢！感激不尽！！
我确认一下你的分析步骤，你是做皮层的统计分析，先设置模型和估计模型，有查看结果（Results模块）吗？然后你再做的ROI的统计分析，是这样吗？
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你好，谢谢提醒，我会注意的。是的，做的皮层的统计分析，设置和估计模型都成功了，然后设置矩阵：f检验，输入：
1 -1 0
1 0 -1
之后选择p为0.05,图谱选择为DK40，选择指标thickness，之后就出现这样的报错，烦请您指导一下这个要怎么解决
虽然你这里用的F contrast是可以的，但是好像不是CAT12使用手册上使用的。所以可以试一试。
对了，我忘了问了，vertex-wise的统计结果还是正常显示的，只是说ROI-wise的分析会报错，对吧？
老师你好，vertes水平的统计是正常的，不管是用您刚刚建议的矩阵还是 1 -1 0这样的矩阵，都可以成功；
然后按照您的建议更改了矩阵，报错和之前一样，图1-3；之后尝试了重新添加cat12至工作路径，报错改变了，如图四
另外老师看到您这个回复自己不太理解，我理解的cat12做anova只能得到三组有差异的脑区（一个脑图），不能体现两组间的差异，需要把这些差异脑区的值提出来，再做两两比较（比如箱图之类的），不知道和您的理解是否一样？谢谢您！
是的，有两种做法，一种是先做F-test，然后把差异脑区提取出来两两比较。另一种是，在voxel-level去做两两比较，如果是这种，我建议就不做F-test了。
目前我的问题是vertex水平结果不能通过矫正，所以才做的roi分析，三组的话是需要做anova，但是这个anova怎么一直报错？如果分开做两两的t检验会被argue吧？
你这里应该不存在多个版本的CAT吧（即使旧版本文件夹改名了也不行）？
CAT的报错我其实也看不懂，我自己的经验是，如果CAT报错，可能换一个版本就好了，因为CAT更新特别频繁，小bug不断，特别是关于surface的分析。
另外，你也可以考虑不用CAT做统计，其实如果是ROI的数据，我感觉用SPSS或者R要更容易。
最佳的解决办法还是去SPM邮件列表里提问，CAT的作者Christian Gaser的回复一般都很及时。
我觉得不会，你只要两两分开做的时候控制一下多重比较就行了。比如，如果是三组，任意两组做T检验，就比较了三次，显著水平卡在0.05/3就行了。
当然，你不用完全相信我说的，我只是根据我的理解给你提供一些思路，你可以多查一查其他来源的资料。这些统计方面的基本问题应该有很多资料可以参考。（你如果查到有不同的看法，也欢迎和我讨论）
是的，我不存在多个版本的cat，下载的是最新版本的；
对于roi的数据spss是可以的，但是理论上要先筛出有意义的脑区对吧？另外我想得到脑图，不知道老师还有其他可以做统计的软件建议吗？
spm邮件列表里我也会去提问的，辛苦老师！
另外，你的spm12版本也可以尝试换一下最新版本的。
对于ROI的分析，因为涉及到多重比较校正，确实还是应该先做F检验，并对F检验的结果进行校正。不过这个肯定是可以在SPSS里做的。
我自己是习惯于用R做统计分析。画图的话，可以尝试ggseg（https://ggseg.github.io/ggseg/）或者enigma toolbox（https://enigma-toolbox.readthedocs.io/en/latest/pages/12.visualization/index.html），前者基于R，后者可以用MATLAB。这两个工具的可视化效果都是文献里常见的。
老师，我的spm12和cat12都是重新下载的是用的最新版本
eniogma toolbox是那种输入图像就可以做统计分析的工具包吗？已经被这个统计搞了好几天了
好的，那可能的因素都排除掉了。
enigma toolbox我只用来做过可视化，其他功能没用过，也不清楚还有哪些功能。如果是nii的数据，每个常用软件的统计模块几乎都可以做，但是对于CAT12的皮层分析，我不知道除了CAT本身还有什么软件可以做。
从前面的讨论下来，我可能倾向于认为你遇到的错误是CAT12的Bug，除了SPM的邮件列表，你也可以直接给CAT作者写邮件，回复会更快一些。