你怎么知道这两个ROI区域是有的？你是在MNI空间提取的吗？
对 在MNI空间，打开对应着区域看的
或许我是不是应该在个体空间去计算
你如果是用个体被试转换到MNI空间的图像来提取数据，那看MNI空间的模板就行。你有对模板进行重采样吗？
嗯 有的 重采样到功能体素大小
重采样以后还有这些区域吗？另外，是每个被试的数据都是这样吗？你可以用3dROIstats或者fslstats试试，看看能识别出多少个脑区来
重采样后也是有的，这两个命令试过也都是缺少那两个区域。很神奇。。不过我感觉用它来做静息态功能连接可能也不合适。
老师有没有类似图谱的推荐，就是既包括皮质也包括皮质下核团（及其亚区），用于做静息态功能连接的
你可以把分区模板发我邮箱（free_learner@163.com），我空了看看，为啥会这样。至于说哪个分区图谱最好或者适合于分析静息态fMRI，好像也缺乏一些实证的证据。我看你前面也试了好多，Schaefer/Tian/Glasser等等，我自己觉得还是看你自己想要分析哪些区域，可能需要把不同的分区模板结合一下，比如，如果是分析海马亚区、杏仁核亚区，我觉得还是FreeSurfer认可度高，如果是要分析Yeo网络，那我觉得Schaefer的最合适，毕竟是同一个团队的工作。
好的！就是这个老师：
JulichBrainAtlas_3.0_areas_MPM_b_N10_nlin2ICBM152asym2009c_public_11035603b47442.gz (327.4 KB)
我用3dROIstats看了一下总共是314个区域，从1-157、1001-1157，还缺少哪两个区域？
左侧的85和112，右侧的都有，老师
我测试的结果是，85和112都是有的呀。你运行下面的代码，不会出现85和112吗？
3dROIstats -quiet -mask JulichBrainAtlas_3.0_areas_MPM_b_N10_nlin2ICBM152asym2009c_public_11035603b47442.nii.gz JulichBrainAtlas_3.0_areas_MPM_b_N10_nlin2ICBM152asym2009c_public_11035603b47442.nii.gz
对 在提取COG的时候也是有的，但是在提取i平均时间序列或计算功能连接时就缺少这两个区域
那说明你的输入数据（也就是用来提取时间序列的fMRI数据）可能有点问题。因为命令本身不太可能有错，上面的测试说明分区模板本身也是没有问题的。
好的老师，我再查看一下。谢谢~
嗯嗯，你再看看，如果发现不了问题，也可以邮箱发我一个样例数据，我看看能否找到问题。