AFQ报错

问答讨论
1

用AFQ做确追，先把文件夹按规定格式整理好，以后用AFQ_run成功追踪出了20条纤维。这时候想用segementcerebellum追踪小脑纤维，但是报错:
捕获2.PNG

捕获1.PNG
捕获1.PNG1068×632 28.8 KB

2

这个是在win还是linux下

3

是在linux系统下的

4

我看官网说，可能还需要一个vistasoft，不知道加上这个软件后，现在怎么样了？可以顺利跑通了吗？

5

楼主，我想请教一下，AFQ是不是只能代码跑啊，没有图像用户界面，最近刚开始看到这个，比较好奇

6

我在使用AFQ做全脑纤维追踪时也是报错，关键是有时能正常跑通，怎么解决呢？
代码如下：

dt=dtiLoadDt6('dt6.mat'); %导入刚生成的dt6.mat文件
afq=AFQ_Create(); %生成一个AFQ的结构体，该结构体包含了纤维追踪所需要的默认参数
wbfg=AFQ_WholebrainTractography(dt,'',afq);%对该被试进行全脑追踪

报错信息如下：

Error using zeros
Size vector should be a row vector with real elements.

Error in dtiRoiClean (line 55)
roiMask = zeros(diff(bb)+1);

Error in AFQ_WholebrainTractography (line 116)
   roiAll = dtiRoiClean(roiAll,3,{'fillHoles'});
7

目前在学校超算matlab可视化平台可以跑通，报错原因可能和软件版本冲突有关，需要多尝试

8

是的，github里面有比较详细的一步一步的教程，再结合文献学习

9

好的，谢谢

10

老哥，我也出现相同的错误，不知道怎么回事？你的解决了吗？我的一次都跑不起来