请问，Ubuntu22.04系统新下载的Freesurfer 7.3.2版本，recon-all都没问题，但是分析局部回指数localGI时候，提示ERROR：Matlab is required to run mris_compute_lgi!。我已经使用fs_install_mcr 安装了R2014b和R2019b两个版本的matlab镜像（freesurfer文件夹已经有了MCRv84和MCRv97两个文件夹），但是仍提示这个ERROR，请问该如何操作？还需要挂载或者配置环境之类的吗？谢谢！！！
我印象中跑lGI并不需要matlab runtime，只要安装了matlab就行。你在命令行中能打开matlab吗？
另外，我记得好像FreeSurfer里的lGI似乎在6.0以后已经停止更新了（比如：https://www.mail-archive.com/freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu/msg60555.html），不确定还能不能用。
matlab可以直接打开，但还是这个错误。FS版本7也可以计算LGI啊，还能是啥原因呢？
我看官网镜像下载链接，按照这个下载的
https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/MatlabRuntime
我知道FreeSurfer可以下载matlab runtime，而且下载了matlab runtime以后就不需要安装matlab了。但是lGI并不需要安装matlab runtime。这是FreeSurfer lGI的介绍页面，并没有提到matlab runtime：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/LGI
我自己知道是做海马亚区分割等等，FreeSurfer才需要安装matlab runtime。
可是，为啥我在运行recon-all -s patient01 -localGI的时候就ERROR：Matlab is required to run mris_compute_lgi!
我安装的最新版本freesurfer啊，也配置了环境变量。这个怎么解决？还请指教，谢谢！
那确实挺奇怪的，你能在命令行输入which matlab看看吗？如果这个能输出matlab正确安装的位置，那我确实不太知道为什么了。
输入which matlab没有反应啊
那就说明你的matlab没有成功加到环境变量里。但是你在命令行输入matlab似乎又可以打开matlab，难道你是用了alias？
我看了一下make_outer_surface应该是FreeSurfer的matlab文件夹里的函数，难道你没有把这个路径加到matlab的startup.m里？我看前面你加了的呀。
我的home//matlab文件夹里只有startup.m文件，就是上面那个截图，然后我的freesurfer安装文件夹的matlab文件夹里也有make_outer_surface.m啊，这是咋回事？
我也觉得奇怪，因为你前面展示了startup.m里的内容，应该是已经设置好了。你可以打开matlab，看看freesurfer/matlab的目录有没有加载到matlab的路径里，确认一下。
感谢Alex大佬！！！
matlab，set path ，加入usr/local/freesurfer/matlab，跑通了