我手里现在有一批DTI的数据,读取头文件信息的时候,我发现每个被试的TR,TE并不完全一样,请问这会影响后续的分析吗?后续我打算做ROI-ROI的连接,以及种子点的连接。下面这张图片上附上了TR和TE,单位是ms,请大家帮我看一下,谢谢。
似乎除了一个数据以外(这个数据明显参数不一样),其他数据的TR/TE都非常接近,我感觉应该是正常情况,如果它们的b值和方向数是一样的话?
b值和方向数都是一样的。 因为我之前看功能像数据的TR和TE都是完全一样的,所以我以为DTI的也得是完全一致的才行。如果不一致的话,论文里是报告平均TR吗?
我自己并没有遇到过(注意过)这种情况,所以我并不清楚为什么会TR/TE稍微不太一致。我遇到过的情况是比如b值设定的是1000,但是实际b值是950(而且每个volume都不一样),文章里还是会写1000。
我之前有看过一些文献的TR会报告小数,我猜他们应该是报告了平均数。
另外,你确定你的数据是在同一台机器同一序列扫描的吗(这个在头文件里也应该能看到吧)?如果是的话,其实TR/TE差一点肯定是没啥影响的。
嗯嗯,机器和序列都是一样的,除了那个TR5000多的被试不一样,其他8600+的都是飞利浦扫的。
不过这批数据很奇怪,用MRICron转换不出json文件,MRIConvert能转出来json,但是明显不对。
你还是用的dcm2nii吗?可以试试dcm2niix。同一个人开发的,但是dcm2nii已经停止更新了。
我换过MRIcroGL转换,它自带的是dcm2niix,不过转换出来的bvec文件都是0,也没有json。最终还是只能回归最老版本的mricron,起码bvec是对的。
我看有的DTI文献报告TR时是报的范围
嗯嗯,现在看来这种细微的差别应该是不影响结果的,谢谢你