求助：利用脑部MRI图像进行脑区域分割的相关方法或者材料
你说的脑区域分割是指的分割什么？分割组织（白质/灰质）还是脑区（海马/杏仁核）？
谢谢老师的回复。
两者都可以，更倾向于脑区分割，不知道老师有没有什么好的建议吗
组织分割的话，我用过FSL的FAST，SPM12的segment模块，ANTs的antsAtroposN4.sh等等。脑区分割的话，皮层分区和皮下核团不太一样，因为一般皮层分区没有明显的边界，所以主要是靠分区模板和配准来实现；皮下核团的话，我只用过FreeSurfer和FSL的FIRST。我想这些软件你估计也知道，还是要根据具体的研究问题来选择了。
老师好，我用atropos 这个命令进行2类组织分割的批量处理时，发现有个别几个被试没有分割的结果，并且也没有报错信息提示。用antsAtroposN4.sh也试过 报错提示为 inputs do not occupy the same physical space
想问一下这可能是什么原因以及如何解决，谢谢啦~
你能说一下你用的具体的命令和参数吗？另外，最好是新开一个帖子讨论问题，因为这个问题和原贴不相关。