大家好。
手头的数据是功能像数据，有任务非rest，该任务有两个run，也就是nifti有俩文件。
现在做功能连接，给图片降噪之后（denoising/nuisance regression）有两个降噪后的文件（使用fsl的film_gls），现在需要将其合并起来，我不知道该如何实现这一步，考虑到有两个方案，但不知道哪个对：
- 使用fsl的flameo，esrimator选用fix，进行固定效应分析，这样可以得到残差；
- 直接把film_gls的结果直接用fslmerge -t合并起来
不知道哪种对或者应该是其他的方案，请各位赐教
我已经知道1是错的了，那样应该得到的残差只有两个volume
Alex
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我可能会在每个run上分别算指标，然后再平均。不过我并不知道这样做和直接连接数据哪种更合理。
我没说完全，我不是计算指标，是进行stepwise connectivity，即选取一个seed，然后通过bct的findwalk看信号从seed点如何一步一步传到后面的脑区。
不太了解你的分析方法，我觉得如果是block design，看信号在每一个block里面的传递，fslmerge看起来没问题。
我做静息态的HMM如果有多个数据的话，可以分别建模，比较结果的稳定性/可重复性。供参考。