MNI坐标空间

问答讨论
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各位老师同学好，假如我有个坐标（a, b, c）,以及有一个AAL文件，读出来的三维矩阵大小为181*217*181，能不能找到这个坐标在这个矩阵空间里对应的位置？谢谢

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dpbai view 就有这个功能

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我试试，谢谢

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从voxel coordinate变换到real world coordinate，对坐标做一次纺射变换就可以，当你的read world spaces配准到了MNI space，转换后就是标准空间。

放射变换的矩阵一般都记录在NIFTI头文件中，比如：

11.png
11.png2220×200 29.4 KB
22.png
22.png998×444 42.6 KB

voxel coordinate – > real world coordinate：变换矩阵*[x y z 1]^T
real world coordinate – > voxel coordinate: 变换矩阵的逆矩阵*[dx dy dz dm]^T

当然一般的读图软件都是有这个功能的，比如fslview, mricron

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非常感谢，问题已经解决啦！

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请问怎么将read world space配准到MNI space？是不是我的head.mat是MNI空间的nii文件的转换过来就是MNI坐标，是个体空间的，转换过来就是个体空间？

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这里讨论的问题应该是物理坐标和体素坐标的转换，是在同一个空间中的转换（比如MNI空间）。如果你想进行个体空间和MNI空间的转换，需要进行图像的配准。

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我和您的理解是一样的，但是昨天有人和我说MNI坐标和MNI模板不一样，个体空间也能有MNI坐标