MNI坐标空间

各位老师同学好,假如我有个坐标(a, b, c),以及有一个AAL文件,读出来的三维矩阵大小为181*217*181,能不能找到这个坐标在这个矩阵空间里对应的位置?谢谢

dpbai view 就有这个功能

我试试,谢谢

从voxel coordinate变换到real world coordinate,对坐标做一次纺射变换就可以,当你的read world spaces配准到了MNI space,转换后就是标准空间。

放射变换的矩阵一般都记录在NIFTI头文件中,比如:

voxel coordinate – > real world coordinate:变换矩阵*[x y z 1]^T
real world coordinate – > voxel coordinate: 变换矩阵的逆矩阵*[dx dy dz dm]^T

当然一般的读图软件都是有这个功能的,比如fslview, mricron

非常感谢,问题已经解决啦!

请问怎么将read world space配准到MNI space?是不是我的head.mat是MNI空间的nii文件的转换过来就是MNI坐标,是个体空间的,转换过来就是个体空间?

这里讨论的问题应该是物理坐标和体素坐标的转换,是在同一个空间中的转换(比如MNI空间)。如果你想进行个体空间和MNI空间的转换,需要进行图像的配准。

我和您的理解是一样的,但是昨天有人和我说MNI坐标和MNI模板不一样,个体空间也能有MNI坐标