大家好，请问做完TBSS 之后是用cluster 这个命令汇报结果吗？如果想知道是哪个纤维束或者脑区的白质具有统计学差异，应该怎么做呢？谢谢！
cluster用于生成显著的团块。如果想知道这些团块的属于什么结构或纤维束，需要使用atlasquery这个命令，详细用法参见FSL官网：https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/Atlasquery
谢谢，我已经尝试过atlasquery 这个命令了，用的是cluster 得到的vox 坐标，但是atlasquery 总是说显著区域团块unclassified 这种情况该怎么办呢？
这说明FSL自带的分区模板里没有包含这个坐标位置的标签。一个解决方法是更换一个分区模板，FSL 6.0.2后有一个新的XTRACT atlas包含的白质区域更广泛一些。另外，你不用一个voxel坐标去查询，试试用整个cluster mask查询。
谢谢，我在FSL邮件列表也查到了一个相似的命令autoaq，并且采用您所说的XTRACT atlas之后的确有label出来了，然后我发现有的cluster比较大，3w+的体素，汇报结果的时候是不是如同xjview那般，除了峰值坐标所在的区域，该cluster中比较大的部分所在的白质区域也应该汇报呢？谢谢
是的。如果cluster比较大，只报告峰值会漏掉很多信息。
你在cluster 命令中加上 --mm选项，生成的坐标是毫米坐标，有些模板我用voxel坐标的时候就查不出来，用mm坐标就可以。
谢谢，我也是用mm坐标查出来了。我还有个疑问，不知是否可以解答。通常查询团块的坐标只会报告峰值坐标,但是我的团块很大，我也想汇报其他团块，请问如何查询非峰值区域的那些坐标呢？
我记得cluster命令可以输出质心坐标，就是加权平均后的中心坐标，你可以看一下这个。另外，如果你的cluster比较大的话，那应该比较少吧，可以用fsleyes视觉查看。导入标准控件图像和统计结果，在fsleyes里面打开atlas panel，就可以了。可以看一下我的博客哈哈 https://www.wetiqe.xyz/quirying-atlas-using-fsleyes-or-command-line-tool-f0d51934dae940729147d7f688604cd6#260e8ca6e12b49268eb14128d0cfe4c0
还有一点，fslwiki上面写的说，cluster很大的话只是代表这个cluster有区别，并不能说明cluster覆盖的地方都有区别。如果cluster很大的话，最好结合着原始数据就是tstat文件看一下
谢谢你的回复，中心坐标和峰值坐标我都试过了，我是觉得因为cluster太大，里面包含的信息很多，如果只是汇报峰值坐标或中心坐标所在的纤维束，那就会遗漏很多信息，所以我觉得里面包含比较多的体素所在的纤维束也应该汇报
您好，我的汇报结果是1个大的cluster，但是会在下面标注很多团块，后面的数值应该怎么理解呢？我看相关文献也有对年龄和性别进行协变量回归，但是没有找见对应的命令，向您请教。
没懂你的意思，能给个截图之类的吗？第二个问题能描述得详细一些吗？
你是说后面这些MAX什么的是什么意思吗？这些就是峰值和峰值坐标。如果cluster太大，可以提高一下显著性水平，让大cluster分裂成小cluster，这样报告结果会更清晰一些。
应该是属于这个脑区的概率，autoqc调用atlasquery，所以直接查看atlasquery的文档即可。