Connectome Workbench使用

如何将标量数据映射到标准脑图像上,得到像ALFF那样的map图。

听说Connectome Workbench这个软件可以实现,但是可参考的资料太少了

模版用的是yeo的7个网络的

不清楚你的具体问题是什么?据我了解,Connectome Workbench主要是用来处理CIFTI数据,其中wb_view是一个比较不错的可视化工具。参考资料的话,就像学习其他软件一样,可以参考官方的文档、课程以及通过在官方论坛上提问跟开发者直接交流。此外,很多包基于Connectome Workbench构建,如果你习惯在python/R等环境下操作数据,可以直接用这些工具包。比如我经常使用R环境下的ciftiTools,这些包经过二次封装会更简单一些。

我从结构DTI和功能fMRI图像中得到了结构连接和功能连接,然后又得到了多个脑区的结构功能耦合值(标量值,例如额中回的耦合值为0.8),我又想将这些耦合值重新映射回.nii图像上,方便我后续输入到JuSpace工具包(这个工具包只能输入.nii格式文件)中做进一步分析。现在主要是想做重新映射的这一部分。不知道这个软件能否实现,如果这个软件不可以是否有其他推荐的软件可以实现?

如果你的目的是将每个脑区的统计值(比如结构功能耦合值)映射回nii文件中,然后输入JuSpace进行后续分析,这是非常常见而且并不复杂的操作。具体实现的话,workbench可以将这种分区数据映射回CIFTI格式(比如wb_command -cifti-convert),而不是NIFTI,所以是无法满足你的要求的(也可能workbench确实能做到,只是我不知道)。我觉得简单的方法是直接用编程实现,你把需求告诉AI,应该就没问题,当然你自己在概念上要理解操作的逻辑。如果你看不懂AI的回复,或者无法成功,我们可以再讨论。