关于spm重采样后图像被裁剪的问题

问题描述:我现在有一个全脑的mask(左侧),但是这个mask与我的数据维度(右侧)不一致,我想把左侧的mask与右侧数据的对齐。


解决过程:我首先想到的是用spm对mask重采样到右侧数据的空间中,但是在做完后,我发现mask被截断了一半。

我使用ITK-snap查看了原始的mask以及我数据的信息,我发现他们的原点和Z轴相差很大,可能问题出现在这里,我数据的信息为size: 147 × 200 × 135,spacing: 0.2 × 0.2 × 0.2,origin: 14.6, 14.4, -3.6,参考图像原始的mask的信息size: 112 × 144 × 38,spacing: 0.25 × 0.25 × 0.5,origin: 0, 0, 0。
我不确定该如何解决这个问题,我目前想将mask的维度与我的数据一致,同时不想丢范围。

你首先要确定mask和你的数据是否在同一个空间下,可以在看图软件中将这两个图像放在一起查看,虽然两个图像维度不同,但很多看图软件会自动重采样。如果两个图像是同一个空间下,应该重叠得很好;如果重叠不好,说明不在同一空间下。