问题如下，似乎是白质分割不完全。想请教一下解决此问题的方法，还是说只能手动分割修复？另外想问一下，除freesurfer外用fsl图谱分割计算脑区的体积误差是否过大？
- 这种情况我也遇到过，我感觉应该是颅骨去除不太成功，剩下的脑膜导致皮层重建失败（defect太多）。我觉得可以试试FreeSurfer的v7/v8版本，在颅骨提取方法上有提升或者使用其他颅骨去除方法更正以后再重建皮层。我一般遇到这种情况直接丢弃这部分数据。
- FSL只能做voxel-based morphometry，至于结果的准确性其实很难量化和相互比较。如果FSL能满足你的分析需求，也是可以的。另外，也可以考虑CAT。
好的，非常感谢！