这取决于你用什么软件进行预处理。如果你使用的预处理软件只能设置统一的参数，那么只能分开处理了。
可以放在一起做后处理，但是需要考虑站点效应或者参数效应。比如，将站点作为协变量进行控制或者使用更复杂一些的模型，比如ComBat（不过我没用过）。
前面也有相关的讨论：https://brainbbs.cn/t/topic/244
另外，使用ADNI数据集发表的论文已经很多了，你也可以参考一下文献，看看别人是怎么处理站点和参数效应的（因为我自己没用过，所以不清楚这方面的文献）。
这取决于你用什么软件进行预处理。如果你使用的预处理软件只能设置统一的参数，那么只能分开处理了。
可以放在一起做后处理，但是需要考虑站点效应或者参数效应。比如，将站点作为协变量进行控制或者使用更复杂一些的模型，比如ComBat（不过我没用过）。
前面也有相关的讨论：https://brainbbs.cn/t/topic/244
另外，使用ADNI数据集发表的论文已经很多了，你也可以参考一下文献，看看别人是怎么处理站点和参数效应的（因为我自己没用过，所以不清楚这方面的文献）。